中央空调计费系统的运行费用在选择空调方案，制定物业收费等工作中都起到了关键的作用。通常设计研究和开发商都是简单地以楼宇在冬夏季的电量（电费）差异来计算中央空调供冷的运行费用。由于没有认真分析和考虑在投资、运行、维护等方面的费用，计算的结构并不能全面的反应实际的运行成本。
艾科中央空调系统运行费用包括直接能源消耗、维护费用、投资费用分摊三个部分。
1.1直接能源消耗
直接能源消耗包括冷冻站制冷和供冷的直接水、电费用支出。由于末端设备有各楼层电力系统供电，所以已经计入用户电费中，在空调中不再重复计算。冷冻站相关设备包括冷水机组、冷冻冷却水泵、冷却塔等。
由于冷冻机在不同负荷情况下的效率都不同，所以严格地说电耗的计算应该采用实时的方式，通常在方案计算是可以按照全年的需冷量（冷吨小时）来乘以系统的供冷效率（COP）来得出全年的运行电费，需要强调的是此处的系统效率不是冷水机组的EER值，必须考虑冷却塔、水泵等的电耗。通常对于使用离心式冷水机组的系统，供冷系统的综合效率为1.005km/KTH，即1冷吨小时的冷负荷需要1.005度的电耗。
运行的直接水费主要是冷却水系统的补水，已补充冷却塔中水的蒸发消耗。系统冷却水系统循环量一般为0.907m3 /RTH,补水参数为2%，则运行水费为0.018148m3 /RTH，及4.8gal/RTH。
1.2维护费用
中央空调系统的维护费用包括多项，主要有：
①人力费用
中央空调冷冻需要配置固定的操作和简单维护修理人员，同时负责各楼层末端系统的维护和基本维修，对于1000RT的容量，需要配置1名主管，4名技术工人，含税、保险、福利因素后的年薪合计约为20万元。
②保养费用
中央空调系统的保养通常有两种方式，即委托专业公司保养和自行保养。从生命周期总费用对比来看，反而是前者的专业保养更为省钱。保养合同包括了管道清洗，电气检查，机械维护等内容，通常1冷吨年合同金额为200万。
1.3冷却水处理及冷却塔维护
由于在国内的项目建设中大都采用进口原装组件的冷水机组和水泵，所以其维修量相对较少，而冷却塔通常是国产设备，加上气候和环境条件复杂，冷却塔的维护维修量相对比较明显，需要在运行费用汇总单独考虑，主要为冷却水的加药处理和冷却塔的易损件更换，通常的费用指标为每冷吨每年30元。
1.4制冷制补充
冷水机组的制冷剂泄漏因型号和使用年限而各异，对于离心式机组二院，每冷吨年泄漏量大约在2-8磅之间，换算结果为每冷吨每年补充制冷剂的费用为67元。
